信息资源管理学报 ›› 2018, Vol. 8 ›› Issue (3): 12-24.doi: 10.13365/j.jirm.2018.03.012

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基于解剖结构视角的医学学科画像研究

陆伟 李信 任珂   

  • 收稿日期:2018-07-09 出版日期:2018-07-26 发布日期:2018-07-26
  • 作者简介:陆伟,博士,教授,副院长,博士生导师,研究方向为学术文本挖掘、信息检索等,Emai:weilu@whu.edu.cn;李信,博士研究生,研究方向为学术文本挖掘、信息计量等;任珂,硕士研究生,研究方向为信息检索、可视化等。
  • 基金资助:

    本文系国家社科基金重大项目“基于认知计算的学术论文评价理论与方法研究”(17ZDA292)和国家自然科学基金项目“面向词汇功能的学术文本语义识别与知识图谱构建(71473183)的研究成果之一。

Research on Subject Profile of Medical Science from the Perspective of Anatomical Structure

Lu Wei Li Xin Ren Ke   

  • Received:2018-07-09 Online:2018-07-26 Published:2018-07-26

摘要:

文章在对学术大数据背景下的学科画像需求进行分析的基础上,以医学学科为例,尝试从解剖结构视角出发,对医学从整体、系统、器官和疾病层面进行学科画像,以描绘医学领域的成长历程和发展趋势。首先,文章以MeSH词表中的“Anatomy Category”解剖学大类为基础,分别与SnoMed CT、UMLS和CHV三个词表建立同义映射、实现解剖词汇扩展;然后,以1809—2016年间PubMed收录的全部文献为研究数据集,利用解剖词汇的“绝对频率”和“相对频率”等统计指标和人体图、热图等可视化方法对医学领域进行挖掘、统计分析和可视化。结果表明,从解剖结构视角看,医学总体从单知识点研究转向多个解剖结构共同作用研究,研究的精度也趋向细粒度化和微观化;除此之外,医学学科画像还可以全方位展示医学学科成果发布、研究方向变动、疾病探索深度等内容。

关键词: 学科画像, 解剖结构, 画像标签, 可视化医学大数据

Abstract:

This article tries to draw the profile for the field of medicine and discuss the growth and development trends in the medical field from the perspective of human anatomy. Firstly, we take the “Anatomy Category” in MeSH as basic words, with which SnoMed CT, UMLS, and CHV are used as extensions for Synonymous mapping; then, we collect the whole PubMed articles published between 1809-2016 as experiment dataset, and we descript the field of medicine from the dimensions of the whole, system, organ and disease by using statistical indexes like the “absolute frequency” and “relative frequency” of anatomy words and visualization methods like heatmap, human figure. The results show that with the evolution of medical science integration, anatomy vocabularies transferred from isolated knowledge point to multi-functions. Furthermore, the subject profile of medical science can also display disclosure of medical science results, alteration of study directions and disease exploration depth.

Key words: Subject profile, Human anatomy, Profile label, Visualization, Medical big data

中图分类号: